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• 上卷　小引　請誅邪教狀　與許青嶼侍御書　闢邪論（上）　闢邪論（中）　闢邪論（下）　臨湯若望進呈圖像說　正國體呈稿　中星說　選擇議　摘謬十論　始信錄序　尊聖學疏
• 下卷　引　孽鏡　附：金烏玉兔辯　鏡餘　合朔初虧時刻辨　日食天象驗　一叩閽辭疏　二叩閽辭疏　三叩閽辭疏　四叩閽辭疏　第一不敢受職之畏疏　第二不敢受職之畏疏　第三不敢受職之畏疏　第四不敢受職之畏疏　第五不敢受職之畏疏　第六不敢受職之畏疏　第七不敢受職之羞疏　第八不敢受職之羞疏　五叩閽辭疏　跋一　跋二　跋三　跋四　跋五　跋六　故前欽天監監正楊公光先別傳　故前欽天監監正歙縣楊公神道表