正月十二日（乙亥），上諭內閣曰：恆瑞自台灣帶兵赴援，觀望遷延，種種玩誤；又妄行奏請添兵，張大賊勢。若治以搖惑軍心之罪，即應按軍法立斬；豈福康安曾經屢次出兵，而於行軍紀律尚未之知？幸而朕於剿捕事宜，先機籌畫，早命福康安前往督辦；恆瑞奏請添兵時，福康安已將次到彼，人心鎮定，不至為恆瑞妄誕之詞，遽有搖動。若彼時福康安尚未奉命前往，則台灣祗有常青一人，其將領兵民等見恆瑞係參贊大員，如此張皇失措、奏請添兵，必為其浮言所惑，心懷疑懼，阻其銳氣。不但台灣全郡俱至動搖，即福建內地亦皆人心惶惑，尚復成何事體！恆瑞妄言惑聽，本應即在軍前正法；前次，朕所以稍從寬辦，不即將伊請兵奏摺發抄治罪者，以彼時官軍剿賊尚未得手，正值人心惶遽之時，若遽將恆瑞怯懦張皇之奏，宣播中外，既慮有駭聽聞，兼恐外間無識之徒，以將軍參贊等剿捕賊匪奏請添兵，朕轉斬而不與，妄生論議。是以未即宣示，止降旨福康安即令恆瑞回京。今剿捕事務業已將次完竣，即是不須添六、七萬大兵之明驗；恆瑞前此妄言之罪，自應核辦。試問之福康安，現在豈待恆瑞請添之兵到彼，始能解圍破賊、攻剋賊巢耶？恆瑞前次所奏，非妄言惑聽而何？朕因念恆瑞年輕無識，且係宗堂，姑援議親之條，不即置以重典，僅令回京候旨，已屬格外施恩。乃福康安節次奏到之摺，曲為庇護，將恆瑞聯寫銜名，又屢於摺內聲敘恆瑞帶兵打仗。試思伊為滿洲大臣，眾皆打仗；伊不打仗，逃往何處乎？且屢經令福康安向恆瑞逐款嚴詰。妄請添兵，搖惑軍心，是其首罪；乃福康安並不問此一條，轉為之多方開脫。且稱其打仗奮勉，仍請留於軍營。該處帶兵如鄂輝、舒亮、普爾普等之遠勝恆瑞者，正復不少，豈必須恆瑞一人？其意不過遇有帶兵打仗，即可將恆瑞亦補敘功績，冀朕加恩錄用。又前因保寧在四川將軍總督之任，足資倚任；而福建將軍在目前為要缺，是以將鄂輝調任福州，以資鎮馭。嗣因保寧補放伊犁將軍，川省現無熟悉番情之人，故仍將鄂輝調回成都；而以常青仍為福建將軍。福康安具奏時，尚未知保寧調任伊犁之信，何以欲將鄂輝仍留成都？福康安不過因恆瑞本係福州將軍，希冀仍留恆瑞原任之意。福康安自問，常青不如恆瑞之為將軍耶？此等處，豈能逃朕洞鹽。福康安由垂髫豢養，經朕多年訓誨，至於成人；今甫經委任畀以軍旅重寄；即現在剿捕賊匪，攻剋賊巢，皆朕指授方略，再三訓示，將士等踴躍用命，始能所向剋捷。今甫經解圍得勝，朕即優加獎賞，福康安自當倍加感奮，迅速擒拏賊首，剋日蕆功，以期承受恩眷。乃竟敢藉此微勞，袒護親戚，此等伎倆豈能於朕前嘗試耶。本應從重治罪，因念其現在帶兵剿賊，業經攻剋巢穴、拏獲逆犯家屬，姑從寬免其深究；著傳旨嚴行申飭。福康安惟當益知愧懼，力改前非。若能將林爽文、莊大田生擒解京，尚可將功補過，仰承恩眷。至恆瑞仍著福康安遵照前旨，革去職銜。伊係宗室，不忍拏問，令其自備資斧，速行來京交部治罪。至輕亦當發往伊犁效力贖罪，以示懲儆。是福康安愛之，實所以害之也。朕辦理庶政，於臣下功罪，賞罰嚴明，惟視其人之自取。而於軍旅重務，有功即賞，有罪必罰，予奪昭然。是以人思奮勵，用能平定西陲大、小金川，拓土開疆，大功屢告。即此台灣逆匪，雖係蕞爾一隅，皆經朕宵旰焦勞，先機決策，未嘗以老而怠，而昏。而於諸臣功罪，尤無一毫假借，內外大臣皆當明喻朕意。
上又命軍機大臣傳諭福康安、海蘭察曰：林爽文、莊大田等罪惡貫盈，為渠魁首惡，非若大名案內之段文經可比。段文經不過一無藉奸民，即使竄匿稽誅，不至慮其復行滋事；然日久不獲，已屬不成事體。況林爽文肆行不逞，罪大極惡，今以如許重兵前往剿捕，必應設法先擒解京，極刑處治；量可容其漏網，遽得謂之完事乎。若此時不行速獲，或至逆首竄往他處，將來大兵撤後，復潛出煽聚，更復成何事體！總之，福康安等，若已將林爽文拏獲，於上元前後奏到，即係伊福分，自可承受恩眷；倘此數日內，竟無擒渠報到，朕即因伊等打仗奮勉，不深究遲滯之罪，伊等自思，亦何顏仰邀茂賞耶？計此旨接到之前，福康安等自已在彼設法擒拏，斷不至俟此旨到日，始行上緊搜捕。但朕宵旰廑懸，倍深焦切，不得不諄諄告誡。福康安等務須益知愧奮，勉圖奏績。
十四日（丁丑），福康安、海蘭察、鄂輝同奏言：前遣社丁杜敷及投出賊目阮和等，分投踩探賊蹤去後。茲據阮和等稟稱，林爽文逃入內山，尚有餘匪二千餘人，聚集小半天山頂拒險死守；又據杜敷稱，探林爽文逃入埔並番社相近地方潛匿，已差生番前往密查，一得確信，即行飛稟各等語。臣等查內山各處隘口，已分派官兵防守，惟小半天山頂地勢極為險峻，有僻逕可通內山，尚為賊據，必須將該處賊匪殲除，招致山後生番堵截，方為嚴密。隨於十八日進兵。臣福康安、鄂輝帶領特勒登徹、穆剋登阿、袁國璜及巴圖魯侍衛等為一路；海蘭察、恆瑞帶領普吉保、許世亨、春寧及巴圖魯侍衛等為一路，俱由前山進攻；普爾普帶同副將張芝元、參將吳宗茂、騎都尉陳大恩、都司劉懷仁，率領廣東屯練兵丁等另為一路，於四鼓前進，繞過大山，夾攻賊後。三路官兵到小半天山麓，時已黎明。該處草深樹密，路徑逼窄，陡險之處，攀藤方可登陟。賊人在山頂拏立木柵，柵內壘石作牆，搭蓋草寮，又將道旁大樹砍倒，橫塞道路，恃其地險，以為久據死守之計。我兵攀緣直上，進至半山，賊匪一齊壓下，勢甚潑猛。臣等傳諭各兵，以山路險惡，無可駐足之地，今已仰攻至此，有進無退。弁兵等俱各踴躍用命，不避鎗砲，蟻附而上，打死賊匪百餘名，賊始竄回柵內，投石放鎗，抵死抗拒。攻圍直至巳刻，普爾普率領廣東屯練官兵攀倒木柵，奮勇先登；賊匪登時潰散，各兵盡力追殺，鎗斃賊目十餘人，生擒賊目林追、林二、林添、孫東湖、王若敬五名，殺賊二百餘人，奪獲鎗砲、鉛藥、器械及馬匹、牛隻、米榖等項，將賊匪木柵草寮全行焚燬。臣等即由該處查看地勢及各處隘口，回營。旋據義民首張源懃帶領社丁陳保並生番頭目十餘人來見；當即酌加賞賚，面詢內山路徑，並跟問逆首蹤跡。僉稱，聞得林爽文現在埔並社、埔尾等處潛匿。所言與杜敷硒探情形，約略相同。臣即令杜敷派撥鑾鑾社、興武郡社、鶴骨社、木格社、致霧社、內外眉社生番，在埔並東南沿溪堵截。其埔並東北一帶山口要隘，雖已嚴密，但遠在山外，不能製其北竄內山之路。已飛飭徐鼎士、徐夢麟等帶領屋鰲等社生番、岸並社熟番，進至內山蛤仔欄等處，在東北面堵截。又令普爾普、普吉保、張芝元帶領兵丁，由內木柵入山，在西北面堵截。查內木柵係生番地界，復派通事黃寬傳集北投地方熟番，引路前進；嚴飭官兵不許稍有擾累生番，令致疑懼。並一面曉諭該番等，加以賞賚，令其各撥番丁，一體幫同堵拏。現在水沙連各社生番，臣等設法招徠，該生番等無不遵奉約束，效力爭先。一俟各路官兵會齊，即帶領大兵由埔並社西南隘口進山搜剿，斷不使逆首逃匿稽誅。再，賊目李七係泉州府同安縣人，為賊中有名頭目，從前即有投誠之信，曾領受恆瑞、蔡攀龍檄諭。臣在廈門時，即聞知此事，到諸羅後，因蔡攀龍籍隸同安，令其遣人招撫，並令泉州義民等分投偵訪，離間賊黨。而李七畏罪遲疑，不敢遽行投出。茲據義民首馬應祖等訪獲李七之母李沈氏、妻李林氏及伊兄李水解送來營。據李沈氏、李水供稱：『李七本是被賊逼迫，無奈順從，早想投出，又懼治他從賊之罪，後來逃在山裡。如今願去尋他，令其投到』等語。臣已將李七母妻暫留，令李水往尋李七，俟投到時，再行究辦。又逆匪滋事之初，攻陷城鎮，各該處文武官員印信，多有遺失。臣自進兵以來，於賊莊內派員逐細搜查，陸續起獲：台灣北路副將關防一顆、北路都司關防一顆、鹿仔港理番同知關防一顆、諸羅縣印一顆、彰化縣分駐南投縣丞關防一顆、彰化縣貓霧捒巡檢印一顆。各印俱被賊人搶去，多有搥損毀壞，不堪鈐用。其台灣府印、彰化縣印，於城陷時，經孫景燧、俞峻家屬帶出，並未遺失。而印文甚屬糢糊，亦須更換。查此次賊平之後，查明緊要地方，添設官員，酌量移駐，印文字樣均應另行擬定。且台灣土語謂「殺」為「台」，而呼「官」字又與「灣」字無異。「台灣」二字，實非吉語，亦應另易嘉名，容俟辦理善後事宜時，酌議具奏。奏入。
上命軍機大臣傳諭福康安、海蘭察、鄂輝曰：前次福康安自十一月二十五日攻破賊巢，遲至十二月初四日始由平林仔發兵前進，使賊匪得以乘暇收合羽黨，於集集埔預為怖置，據險抵拒，已屬辦理遲緩。迨官兵攻剋集集埔後，於十三日在水並社拏獲逆首家屬，福康安等若能及早帶兵直往小半天一帶搜捕，則賊匪窮蹙奔逃，救死不暇，豈能收集黨夥二千餘人；於山頭拏柵、壘牆、搭寮拒守。且官兵進攻山梁時，賊匪投石放鎗，抵死抗拒；彼時，林爽文自必尚在該處潛匿。若福康安等於賊匪未經布置之先，即已統兵前至該處，林爽文豈能據險抵禦。屢次使之乘間逃逸，乃福康安等又不即時前進，延至十八日始帶兵分路攻剿，距拏獲逆首家屬時，中間又隔五日，使賊匪得預為扼險死守之計。是福康安不但有失機宜，且使賊匪得以乘暇設備，又須帶領官兵到處攻剿。即福康安自為計，豈非舍易而就難耶？再批閱圖內，於山外各路口安設營盤，不下二十餘處，計每處派兵四、五百名，已不下萬餘。似此於無甚緊要處零星分派，置之無用之地，豈不又如從前恆瑞、普吉保於鹽水港、笨港一帶，分兵零星堵禦，致兵力以分而見單乎？況福康安在東埔納駐劄，距逆首逃竄之埔並社尚遠，何不前至舒亮駐劄之歸仔社劄營？且現在分兵堵截，自應酌留一、二通內地隘口，毋庸設兵、使林爽文見此數處無兵防堵，或由該處仍逸入內地，不難四路圍截，立就擒獲。今將各隘口悉行設兵堵截，是轉恐其入山不深，驅之使入，豈不失計？福康安此時應將圖內硃筆點出各隘口，酌量將官兵撤去。合兵一、二萬，福康安竟當親自統領，直入埔並社內山，硒探林爽文潛匿處所，跟蹤追捕。即該處生番語言不通，與禽獸無異，今林爽文潛匿內山，亦難與生番通語聯絡。其所帶夥匪僅止一、二千人，尚可四處竄逸，不畏生番；豈福康安帶領大兵數萬，轉慮生番野性難馴，有所畏怯乎？若生番等震懾兵威，將林爽文擒獻，固屬甚善；設使冥頑助逆，即趁此兵力亦無難將生番等痛加殲戮。總之，林爽文逃匿何處，福康安即帶兵向該處跟蹤追剿，以期必獲。此皆福康安節次辦理遲緩，自貽伊戚，其跋涉勞苦，皆所自取。福康安務奮力速進，生擒逆首，以副委任。
十六日（己卯），常青奏言：台灣府城北至嘉義縣一路，前經福康安派令普爾普帶領官兵自縣至府；復自府回縣；往來追捕，賊匪逃遁，道路已通。其府城以南，臣屢次搜剿，勢亦消散；所有敗退竄伏之賊，時或潛出，搶掠覓食。臣營盤雖存兵無多，茲值北路大兵迅掃賊巢，競思振奮，一聞探報賊蹤，立往迎擊，皆能爭先殺獲，賊眾登時奔潰。節准福康安來咨，賊巢業已蕩平，賊首尚未弋獲。臣再嚴飭文武員弁兵役，加緊巡查，不使稍有疏漏。惟查南路賊首莊大田，前聞匿跡大武壠山內；近又訪聞在南仔坑地方。查該處與水底寮一帶，係鳳山縣屬，皆有匪類藏匿，距東港頗近。臣前派副將丁朝雄等收復東港，以通糧路，帶兵一千二百餘名，僅可駐守。今李侍堯挑派內地各營兵一千，現已先到六百五十餘名。不日到齊，臣即酌撥六百名添赴東港；後到三百餘名，派守府城。合計丁朝雄原帶之兵，共有一千八百名，再令會同廣東、泉州等莊義民一、二千，相機前進，開通鳳山道路，就近設法擒拏莊大田並其賊目匪黨。又飭令鳳山縣知縣張陞吉前往該處，將搜出之附合脅從人等，廣為招撫，安插歸莊。並據台灣縣知縣王露曉諭民莊，各舉紳耆聯絡附近莊眾，守望相助，遇賊拏解，仍蹤跡莊大田協擒解獻。奏入。
上命軍機大臣傳諭福康安、海蘭察、鄂輝、常青曰：前此派令福康安赴台灣辦理剿捕逆匪事務；福康安奉命時，即不免有畏難之見。中途屢次奏請添兵，經朕再四降旨詳悉開導。彼時，朕深慮福康安未必能迅速蕆功，已諭令奎林星馳赴京，原欲令其前往台灣幫同帶兵剿捕，並令阿桂赴閩駐劄廈門調度一切，以資策應。及至福康安帶兵渡洋，由鹿仔港進兵，數日之間，即能直抵嘉義縣城，殺賊解圍，打通道路；並即攻剋斗六門，直抵大里杙，摧破賊巢，痛殲匪眾，屢奏捷音。朕初不料其辦理如此迅速，為之喜出望外，是以不次加恩，以示優獎。乃福康安屢與賊人以暇，致失事機。今林爽文業經竄入內山，僅將其家屬拏獲，豈得謂之蕆事。又，焉有官兵始終曠日持久，在彼等候搜捕之理？且生番等頑獷性成，直與禽獸無異，祗可懾以兵威，不可徒事招致與之講解。況各社生番不下數萬，豈能一一感化，一一賞賚。搜捕機宜，全貴迅速。不獨擒拏逆首為然，即如尋常追捕，亦須趁勢及早擒拏；若稍涉延緩，往往乘間遠颺，卒致漏網。上年直隸大名案內首犯段文經，亦因該督等不即查拏，以致該犯遠遁，至今未獲。而林爽文一犯；更非段文經可比；今窮蹙之際，尚敢率領夥黨二千餘人竄入內山。設不即時拏獲，或復行糾合南路賊匪，煽聚滋擾；或繞出大兵之後，仍在大里杙截掠軍糧，皆不可知。爾等亦曾思及此否？至常青本日所奏，不過敷衍塞責。常青在府城駐兵日久，並不能督率將弁將南路賊匪痛加剿殺，廓消道路，竟至一籌莫展，實屬無能。常青亦著傳旨嚴行申飭。又昨據福康安奏，「台灣」二字，以應另易嘉名等語。所奏殊可不必。前此，將「諸羅」縣改名「嘉義」，原因該處義民幫同官兵守城殺賊，咸知大義，甚堪嘉尚，是以特改縣名，用示旌異。至台灣地方，自聖祖平定後，設立府、縣，即以「台灣」命名，沿用至今。其土語與字音偶有訛同之處，亦無甚關係；況並未之前聞，自不當輕議更改。即此時另改他名，而「台灣」二字沿習已久，人亦必仍稱舊名；是即更改，亦屬無謂；此皆捨正務而用心於無用之地矣。著傳諭福康安於辦理善後章程內，祗須將該處改建城垣、添設丞倅兵弁，一切應辦事宜，悉心籌酌妥協，務期一勞永逸。其更改地名一節，毋庸提及，亦不必形之言語也。
十七日（庚辰），常青奏言：府城為南北要衝。此時北路竄走之賊，或與南路匪夥偶通聲息，希圖援救，均未可定。臣於營盤外近山各要隘，並鹿耳門上下口岸督率巡查，多為防範，以期周密。此現在未便分兵南下，遠離府城之實在情形也。所有李侍堯派到舊兵一千，尚未到齊。其先到六百餘名已派撥添赴東港。因訪聞莊大田近日曆潛南路南仔坑或大武壠二處，行蹤無定，臣是以飭令東港帶兵將弁協同義民等固守港口，仍酌量添兵，就近設法相機剿捕。復令地方官撫輯遠近民莊，並懸重賞緝拏首夥各犯。一經獲到，不須多用兵力，而收復鳳山，肅清南路，即可剋期竣事。奏入。
上命軍極大臣傳諭福康安、海蘭察、鄂輝、常青、李侍堯曰：福康安前此具奏柴大紀為人狡詐不可深信一摺，於柴大紀如何貪劣、如何誤事、如何懼賊不進兵實跡，並未列款參劾。經節次降旨飭諭。茲據軍機大臣奏，福康安有寄伊等公信一件，內稱柴大紀守禦縣城，並非伊之力量。福康安到縣城時，面見柴大紀形貌並非勞瘁，馬匹亦皆臕壯，城中糧食並未斷絕。其接奉諭旨不肯帶兵出城一節，亦係義民等不肯將伊放出，伊亦畏賊不敢出城。守諸羅一事，朕不忍以為柴大紀之罪。至於其他聲名狼籍、縱兵激變、不肯帶兵剿賊，柴大紀既有此等情節，福康安於具摺時何不逐款指出，據實參奏？即或因縣城甫經解圍，未便即將柴大紀參劾，亦應將以上各情節，隨摺寄知軍機大臣，令其代陳，朕亦得以悉其原委，可無須再三飭諭。乃福康安未於摺內列款糾參，又不早寄知軍機大臣代奏。試思柴大紀在縣城被圍日久，其奏到接奉諭旨不肯帶兵出城一摺，披閱之下，朕為之墮淚；即在朝諸臣，凡有人心者亦無不以柴大紀竭力守城，稱其義勇。是即柴大紀小有過失，亦當錄其大功而宥其微眚，豈能據福康安所奏柴大紀為人狡詐不可深信一語，遽治以無名之罪。若因此籠統虛詞，即將有功之人加以罪譴，又何以服眾心而示天下耶！此事，福康安具奏含糊，固難辭咎；而李侍堯心存容隱，其咎較之福康安為尤重。前問李侍堯之諭，尚未覆奏，想亦難為措詞耳。本日常青所奏，總不過敷衍塞責，殊屬無謂。前因其初至郡城調度一切尚為妥協，且伊已年老尚能親自帶兵打仗，是以賞戴雙眼花翎，以示獎勵。令半載以來，株守郡城，毫無出力。念其尚無大過，與恆瑞之搖惑人心者有間。伊是閩省情形尚為熟悉，業經補用福州將軍，伊自當照將軍職分戴用單眼花翎。
十八日（辛巳），上命軍機大臣傳諭福康安、海蘭察、鄂輝曰：福康安等自攻剋小半天後，該處距埔並社不遠，各路分派之兵當早已會集，合力搜捕，逆首林爽文自必早就擒獲。日內亦應有奏報擒渠信息，何以尚未見奏到。總之，逆首林爽文若於此數日內奏報擒獲，方為妥協；設再遲延日久，恐逆首輾轉潛匿，搜捕較為費力。此時，福康安既已派兵在內山各隘口分路堵截，其內山東面大洋，並無口岸，自無慮其逃竄；而北路又有熟番等幫同官兵堵截，亦難竄逸。惟向南一路，山徑毗連，或林爽文竟從此路逃竄，與莊大田聚合一處。該處俱屬內地，不難分派官兵悉力搜捕，將賊目、賊首一併擒獲。福康安惟當倍加奮勉，探明逆首逃往何路，跟蹤追捕，立就擒縛，毋令乘間遠逸。若首惡渠魁稽誅漏網，竟至全無下落，尚復成何事體耶！朕為此事日夕焦勞，著再傳諭福康安務遵節次諭旨，直入內山將林爽文迅速拏獲，毋得再事遲緩。
二十一日（甲申），上命軍機大臣傳諭福康安、海蘭察、鄂輝、李侍堯曰：福康安自十一月二十五日攻剋大里杙後，遲至十二月初四日始由平林仔發兵；及攻剋集集埔，在水並社擒獲林爽文父母家屬，又復遲至十八日始攻剿小半天，輾轉稽遲。此必係福康安到彼聽信恆瑞之言，以生番素稱頑梗，獷悍異常，若官兵輕進，必致擾動生番，別滋事端。是以，徐徐進兵隘口，惟事招致，懸立重賞，冀生番等自行擒獻。殊不知此等生番，可以威懾而不可徒以利誘，況各社生番豈能一一賞賚。其未經賞者，又安能望其出力為官兵擒拏逆首耶。計小半天地方，相距林爽文竄逆之埔並社，埔尾，至遲不過三日路程，官兵即可到彼。若已將逆首擒獲，自必具摺馳奏。計本月十七、八日即當奏到。今已閱七日，尚未據奏到擒渠之信，又屬無望。畏事之人，稱內山係生番地界，不種五榖，該處生番俱係打生覓食；林爽文帶領夥匪數千，即在彼潛匿，無從得食。但自林爽文竄入內山以後，於福康安前此發摺時，已閱二十餘日，逆首等並未因人眾乏食，盡皆饑斃。又豈可徒在隘口堵截，林爽文一日不獲，即官兵一日不撤？經年累月與賊相持，雖駐兵日久經費亦屬小事，但台灣地方一交三月氣候即已炎熱，所調官兵內，如屯練貴州及別省兵丁素不耐濕熟。若至彼時尚在該處駐劄，必致易生疾病，其氣更餒。或林爽文聞知官兵不習水土，多有疾病，竟乘間潛出滋擾，或攔截官兵運送糧餉火藥之路，或將官兵前往府城通路中間攔截，關係甚重，皆不可不慮。況南路莊大田現在糾眾肆擾，常青祗辦自守，不能望其帶兵剿捕。設林爽文又在北路逞其狡猾伎倆，牽製大軍，更復成何事體耶。朕意，福康安此時與其在彼駐守，未能直入內山將逆首即時擒獲，豈可老師糜餉，不為改弦易轍之計？約計此旨到日，已屬二月中旬，如福康安已早將逆首擒獲，帶兵前往南路搜捕莊大田，固屬甚善；倘福康安接此旨時，尚未生擒逆首，不可不急思變計。竟當趁氣候尚未炎熱之時，將各隘口官兵撤回，逕趨南路將賊目莊大田拏獲，收復鳳山，肅清道路。其北路一帶，轉不妨示賊以隙，使林爽文聞知大兵業已撤去，或自內山逸出，希冀竄往他處，自尋生路；則逆首竄入內地，轉可易於搜剿。彼時福康安於廓清南路後，復移兵北向，四面截拏，攔其入山之路，自無難將逆首一鼓成擒。即使大兵撤後，難保林爽文不逃入內地，復行煽惑？但此亦不足為慮。前此，林爽文在北路及嘉義滋擾，各處村莊民人原俱被其煽誘迫脅，而大兵一到，無不立時殲除解散，紛紛奔潰。況林爽文當逃竄之餘，豈能復行糾結？即使潛相勾引，該處民人已知官兵聲勢，豈肯一一聽從；縱有聽糾入夥者，亦斷不能如前此之多。官兵再行搜剿，自必如摧枯拉朽，易於撲滅；反可淨盡根株，此事理之顯然者。福康安如尚未拏獲逆首，竟當遵旨而行，不必心存疑慮。倘更有何善計較此為勝者，亦不妨速行。總期大功剋日告蕆，原不必拘執也。
上又命軍機大臣傳諭福康安、海蘭察曰：林爽文、莊大田等罪惡貫盈，為渠魁首惡，非若大名案內之段文經可比。段文經不過一無藉奸民，即使竄匿稽誅，不至慮其復行滋事；然日久不獲，已屬不成事體。況林爽文肆行不逞，罪大極惡，今以如許重兵前往剿捕，必應設法先擒解京，極刑處治；量可容其漏網，遽得謂之完事乎。若此時不行速獲，或至逆首竄往他處，將來大兵撤後，復潛出煽聚，更復成何事體！總之，福康安等，若已將林爽文拏獲，於上元前後奏到，即係伊福分，自可承受恩眷；倘此數日內，竟無擒渠報到，朕即因伊等打仗奮勉，不深究遲滯之罪，伊等自思，亦何顏仰邀茂賞耶？計此旨接到之前，福康安等自已在彼設法擒拏，斷不至俟此旨到日，始行上緊搜捕。但朕宵旰廑懸，倍深焦切，不得不諄諄告誡。福康安等務須益知愧奮，勉圖奏績。
十四日（丁丑），福康安、海蘭察、鄂輝同奏言：前遣社丁杜敷及投出賊目阮和等，分投踩探賊蹤去後。茲據阮和等稟稱，林爽文逃入內山，尚有餘匪二千餘人，聚集小半天山頂拒險死守；又據杜敷稱，探林爽文逃入埔並番社相近地方潛匿，已差生番前往密查，一得確信，即行飛稟各等語。臣等查內山各處隘口，已分派官兵防守，惟小半天山頂地勢極為險峻，有僻逕可通內山，尚為賊據，必須將該處賊匪殲除，招致山後生番堵截，方為嚴密。隨於十八日進兵。臣福康安、鄂輝帶領特勒登徹、穆剋登阿、袁國璜及巴圖魯侍衛等為一路；海蘭察、恆瑞帶領普吉保、許世亨、春寧及巴圖魯侍衛等為一路，俱由前山進攻；普爾普帶同副將張芝元、參將吳宗茂、騎都尉陳大恩、都司劉懷仁，率領廣東屯練兵丁等另為一路，於四鼓前進，繞過大山，夾攻賊後。三路官兵到小半天山麓，時已黎明。該處草深樹密，路徑逼窄，陡險之處，攀藤方可登陟。賊人在山頂拏立木柵，柵內壘石作牆，搭蓋草寮，又將道旁大樹砍倒，橫塞道路，恃其地險，以為久據死守之計。我兵攀緣直上，進至半山，賊匪一齊壓下，勢甚潑猛。臣等傳諭各兵，以山路險惡，無可駐足之地，今已仰攻至此，有進無退。弁兵等俱各踴躍用命，不避鎗砲，蟻附而上，打死賊匪百餘名，賊始竄回柵內，投石放鎗，抵死抗拒。攻圍直至巳刻，普爾普率領廣東屯練官兵攀倒木柵，奮勇先登；賊匪登時潰散，各兵盡力追殺，鎗斃賊目十餘人，生擒賊目林追、林二、林添、孫東湖、王若敬五名，殺賊二百餘人，奪獲鎗砲、鉛藥、器械及馬匹、牛隻、米榖等項，將賊匪木柵草寮全行焚燬。臣等即由該處查看地勢及各處隘口，回營。旋據義民首張源懃帶領社丁陳保並生番頭目十餘人來見；當即酌加賞賚，面詢內山路徑，並跟問逆首蹤跡。僉稱，聞得林爽文現在埔並社、埔尾等處潛匿。所言與杜敷硒探情形，約略相同。臣即令杜敷派撥鑾鑾社、興武郡社、鶴骨社、木格社、致霧社、內外眉社生番，在埔並東南沿溪堵截。其埔並東北一帶山口要隘，雖已嚴密，但遠在山外，不能製其北竄內山之路。已飛飭徐鼎士、徐夢麟等帶領屋鰲等社生番、岸並社熟番，進至內山蛤仔欄等處，在東北面堵截。又令普爾普、普吉保、張芝元帶領兵丁，由內木柵入山，在西北面堵截。查內木柵係生番地界，復派通事黃寬傳集北投地方熟番，引路前進；嚴飭官兵不許稍有擾累生番，令致疑懼。並一面曉諭該番等，加以賞賚，令其各撥番丁，一體幫同堵拏。現在水沙連各社生番，臣等設法招徠，該生番等無不遵奉約束，效力爭先。一俟各路官兵會齊，即帶領大兵由埔並社西南隘口進山搜剿，斷不使逆首逃匿稽誅。再，賊目李七係泉州府同安縣人，為賊中有名頭目，從前即有投誠之信，曾領受恆瑞、蔡攀龍檄諭。臣在廈門時，即聞知此事，到諸羅後，因蔡攀龍籍隸同安，令其遣人招撫，並令泉州義民等分投偵訪，離間賊黨。而李七畏罪遲疑，不敢遽行投出。茲據義民首馬應祖等訪獲李七之母李沈氏、妻李林氏及伊兄李水解送來營。據李沈氏、李水供稱：『李七本是被賊逼迫，無奈順從，早想投出，又懼治他從賊之罪，後來逃在山裡。如今願去尋他，令其投到』等語。臣已將李七母妻暫留，令李水往尋李七，俟投到時，再行究辦。又逆匪滋事之初，攻陷城鎮，各該處文武官員印信，多有遺失。臣自進兵以來，於賊莊內派員逐細搜查，陸續起獲：台灣北路副將關防一顆、北路都司關防一顆、鹿仔港理番同知關防一顆、諸羅縣印一顆、彰化縣分駐南投縣丞關防一顆、彰化縣貓霧捒巡檢印一顆。各印俱被賊人搶去，多有搥損毀壞，不堪鈐用。其台灣府印、彰化縣印，於城陷時，經孫景燧、俞峻家屬帶出，並未遺失。而印文甚屬糢糊，亦須更換。查此次賊平之後，查明緊要地方，添設官員，酌量移駐，印文字樣均應另行擬定。且台灣土語謂「殺」為「台」，而呼「官」字又與「灣」字無異。「台灣」二字，實非吉語，亦應另易嘉名，容俟辦理善後事宜時，酌議具奏。奏入。
上命軍機大臣傳諭福康安、海蘭察、鄂輝曰：前次福康安自十一月二十五日攻破賊巢，遲至十二月初四日始由平林仔發兵前進，使賊匪得以乘暇收合羽黨，於集集埔預為怖置，據險抵拒，已屬辦理遲緩。迨官兵攻剋集集埔後，於十三日在水並社拏獲逆首家屬，福康安等若能及早帶兵直往小半天一帶搜捕，則賊匪窮蹙奔逃，救死不暇，豈能收集黨夥二千餘人；於山頭拏柵、壘牆、搭寮拒守。且官兵進攻山梁時，賊匪投石放鎗，抵死抗拒；彼時，林爽文自必尚在該處潛匿。若福康安等於賊匪未經布置之先，即已統兵前至該處，林爽文豈能據險抵禦。屢次使之乘間逃逸，乃福康安等又不即時前進，延至十八日始帶兵分路攻剿，距拏獲逆首家屬時，中間又隔五日，使賊匪得預為扼險死守之計。是福康安不但有失機宜，且使賊匪得以乘暇設備，又須帶領官兵到處攻剿。即福康安自為計，豈非舍易而就難耶？再批閱圖內，於山外各路口安設營盤，不下二十餘處，計每處派兵四、五百名，已不下萬餘。似此於無甚緊要處零星分派，置之無用之地，豈不又如從前恆瑞、普吉保於鹽水港、笨港一帶，分兵零星堵禦，致兵力以分而見單乎？況福康安在東埔納駐劄，距逆首逃竄之埔並社尚遠，何不前至舒亮駐劄之歸仔社劄營？且現在分兵堵截，自應酌留一、二通內地隘口，毋庸設兵、使林爽文見此數處無兵防堵，或由該處仍逸入內地，不難四路圍截，立就擒獲。今將各隘口悉行設兵堵截，是轉恐其入山不深，驅之使入，豈不失計？福康安此時應將圖內硃筆點出各隘口，酌量將官兵撤去。合兵一、二萬，福康安竟當親自統領，直入埔並社內山，硒探林爽文潛匿處所，跟蹤追捕。即該處生番語言不通，與禽獸無異，今林爽文潛匿內山，亦難與生番通語聯絡。其所帶夥匪僅止一、二千人，尚可四處竄逸，不畏生番；豈福康安帶領大兵數萬，轉慮生番野性難馴，有所畏怯乎？若生番等震懾兵威，將林爽文擒獻，固屬甚善；設使冥頑助逆，即趁此兵力亦無難將生番等痛加殲戮。總之，林爽文逃匿何處，福康安即帶兵向該處跟蹤追剿，以期必獲。此皆福康安節次辦理遲緩，自貽伊戚，其跋涉勞苦，皆所自取。福康安務奮力速進，生擒逆首，以副委任。
十六日（己卯），常青奏言：台灣府城北至嘉義縣一路，前經福康安派令普爾普帶領官兵自縣至府；復自府回縣；往來追捕，賊匪逃遁，道路已通。其府城以南，臣屢次搜剿，勢亦消散；所有敗退竄伏之賊，時或潛出，搶掠覓食。臣營盤雖存兵無多，茲值北路大兵迅掃賊巢，競思振奮，一聞探報賊蹤，立往迎擊，皆能爭先殺獲，賊眾登時奔潰。節准福康安來咨，賊巢業已蕩平，賊首尚未弋獲。臣再嚴飭文武員弁兵役，加緊巡查，不使稍有疏漏。惟查南路賊首莊大田，前聞匿跡大武壠山內；近又訪聞在南仔坑地方。查該處與水底寮一帶，係鳳山縣屬，皆有匪類藏匿，距東港頗近。臣前派副將丁朝雄等收復東港，以通糧路，帶兵一千二百餘名，僅可駐守。今李侍堯挑派內地各營兵一千，現已先到六百五十餘名。不日到齊，臣即酌撥六百名添赴東港；後到三百餘名，派守府城。合計丁朝雄原帶之兵，共有一千八百名，再令會同廣東、泉州等莊義民一、二千，相機前進，開通鳳山道路，就近設法擒拏莊大田並其賊目匪黨。又飭令鳳山縣知縣張陞吉前往該處，將搜出之附合脅從人等，廣為招撫，安插歸莊。並據台灣縣知縣王露曉諭民莊，各舉紳耆聯絡附近莊眾，守望相助，遇賊拏解，仍蹤跡莊大田協擒解獻。奏入。
上命軍機大臣傳諭福康安、海蘭察、鄂輝、常青曰：前此派令福康安赴台灣辦理剿捕逆匪事務；福康安奉命時，即不免有畏難之見。中途屢次奏請添兵，經朕再四降旨詳悉開導。彼時，朕深慮福康安未必能迅速蕆功，已諭令奎林星馳赴京，原欲令其前往台灣幫同帶兵剿捕，並令阿桂赴閩駐劄廈門調度一切，以資策應。及至福康安帶兵渡洋，由鹿仔港進兵，數日之間，即能直抵嘉義縣城，殺賊解圍，打通道路；並即攻剋斗六門，直抵大里杙，摧破賊巢，痛殲匪眾，屢奏捷音。朕初不料其辦理如此迅速，為之喜出望外，是以不次加恩，以示優獎。乃福康安屢與賊人以暇，致失事機。今林爽文業經竄入內山，僅將其家屬拏獲，豈得謂之蕆事。又，焉有官兵始終曠日持久，在彼等候搜捕之理？且生番等頑獷性成，直與禽獸無異，祗可懾以兵威，不可徒事招致與之講解。況各社生番不下數萬，豈能一一感化，一一賞賚。搜捕機宜，全貴迅速。不獨擒拏逆首為然，即如尋常追捕，亦須趁勢及早擒拏；若稍涉延緩，往往乘間遠颺，卒致漏網。上年直隸大名案內首犯段文經，亦因該督等不即查拏，以致該犯遠遁，至今未獲。而林爽文一犯；更非段文經可比；今窮蹙之際，尚敢率領夥黨二千餘人竄入內山。設不即時拏獲，或復行糾合南路賊匪，煽聚滋擾；或繞出大兵之後，仍在大里杙截掠軍糧，皆不可知。爾等亦曾思及此否？至常青本日所奏，不過敷衍塞責。常青在府城駐兵日久，並不能督率將弁將南路賊匪痛加剿殺，廓消道路，竟至一籌莫展，實屬無能。常青亦著傳旨嚴行申飭。又昨據福康安奏，「台灣」二字，以應另易嘉名等語。所奏殊可不必。前此，將「諸羅」縣改名「嘉義」，原因該處義民幫同官兵守城殺賊，咸知大義，甚堪嘉尚，是以特改縣名，用示旌異。至台灣地方，自聖祖平定後，設立府、縣，即以「台灣」命名，沿用至今。其土語與字音偶有訛同之處，亦無甚關係；況並未之前聞，自不當輕議更改。即此時另改他名，而「台灣」二字沿習已久，人亦必仍稱舊名；是即更改，亦屬無謂；此皆捨正務而用心於無用之地矣。著傳諭福康安於辦理善後章程內，祗須將該處改建城垣、添設丞倅兵弁，一切應辦事宜，悉心籌酌妥協，務期一勞永逸。其更改地名一節，毋庸提及，亦不必形之言語也。
十七日（庚辰），常青奏言：府城為南北要衝。此時北路竄走之賊，或與南路匪夥偶通聲息，希圖援救，均未可定。臣於營盤外近山各要隘，並鹿耳門上下口岸督率巡查，多為防範，以期周密。此現在未便分兵南下，遠離府城之實在情形也。所有李侍堯派到舊兵一千，尚未到齊。其先到六百餘名已派撥添赴東港。因訪聞莊大田近日曆潛南路南仔坑或大武壠二處，行蹤無定，臣是以飭令東港帶兵將弁協同義民等固守港口，仍酌量添兵，就近設法相機剿捕。復令地方官撫輯遠近民莊，並懸重賞緝拏首夥各犯。一經獲到，不須多用兵力，而收復鳳山，肅清南路，即可剋期竣事。奏入。
上命軍極大臣傳諭福康安、海蘭察、鄂輝、常青、李侍堯曰：福康安前此具奏柴大紀為人狡詐不可深信一摺，於柴大紀如何貪劣、如何誤事、如何懼賊不進兵實跡，並未列款參劾。經節次降旨飭諭。茲據軍機大臣奏，福康安有寄伊等公信一件，內稱柴大紀守禦縣城，並非伊之力量。福康安到縣城時，面見柴大紀形貌並非勞瘁，馬匹亦皆臕壯，城中糧食並未斷絕。其接奉諭旨不肯帶兵出城一節，亦係義民等不肯將伊放出，伊亦畏賊不敢出城。守諸羅一事，朕不忍以為柴大紀之罪。至於其他聲名狼籍、縱兵激變、不肯帶兵剿賊，柴大紀既有此等情節，福康安於具摺時何不逐款指出，據實參奏？即或因縣城甫經解圍，未便即將柴大紀參劾，亦應將以上各情節，隨摺寄知軍機大臣，令其代陳，朕亦得以悉其原委，可無須再三飭諭。乃福康安未於摺內列款糾參，又不早寄知軍機大臣代奏。試思柴大紀在縣城被圍日久，其奏到接奉諭旨不肯帶兵出城一摺，披閱之下，朕為之墮淚；即在朝諸臣，凡有人心者亦無不以柴大紀竭力守城，稱其義勇。是即柴大紀小有過失，亦當錄其大功而宥其微眚，豈能據福康安所奏柴大紀為人狡詐不可深信一語，遽治以無名之罪。若因此籠統虛詞，即將有功之人加以罪譴，又何以服眾心而示天下耶！此事，福康安具奏含糊，固難辭咎；而李侍堯心存容隱，其咎較之福康安為尤重。前問李侍堯之諭，尚未覆奏，想亦難為措詞耳。本日常青所奏，總不過敷衍塞責，殊屬無謂。前因其初至郡城調度一切尚為妥協，且伊已年老尚能親自帶兵打仗，是以賞戴雙眼花翎，以示獎勵。令半載以來，株守郡城，毫無出力。念其尚無大過，與恆瑞之搖惑人心者有間。伊是閩省情形尚為熟悉，業經補用福州將軍，伊自當照將軍職分戴用單眼花翎。
十八日（辛巳），上命軍機大臣傳諭福康安、海蘭察、鄂輝曰：福康安等自攻剋小半天後，該處距埔並社不遠，各路分派之兵當早已會集，合力搜捕，逆首林爽文自必早就擒獲。日內亦應有奏報擒渠信息，何以尚未見奏到。總之，逆首林爽文若於此數日內奏報擒獲，方為妥協；設再遲延日久，恐逆首輾轉潛匿，搜捕較為費力。此時，福康安既已派兵在內山各隘口分路堵截，其內山東面大洋，並無口岸，自無慮其逃竄；而北路又有熟番等幫同官兵堵截，亦難竄逸。惟向南一路，山徑毗連，或林爽文竟從此路逃竄，與莊大田聚合一處。該處俱屬內地，不難分派官兵悉力搜捕，將賊目、賊首一併擒獲。福康安惟當倍加奮勉，探明逆首逃往何路，跟蹤追捕，立就擒縛，毋令乘間遠逸。若首惡渠魁稽誅漏網，竟至全無下落，尚復成何事體耶！朕為此事日夕焦勞，著再傳諭福康安務遵節次諭旨，直入內山將林爽文迅速拏獲，毋得再事遲緩。
二十一日（甲申），上命軍機大臣傳諭福康安、海蘭察、鄂輝、李侍堯曰：福康安自十一月二十五日攻剋大里杙後，遲至十二月初四日始由平林仔發兵；及攻剋集集埔，在水並社擒獲林爽文父母家屬，又復遲至十八日始攻剿小半天，輾轉稽遲。此必係福康安到彼聽信恆瑞之言，以生番素稱頑梗，獷悍異常，若官兵輕進，必致擾動生番，別滋事端。是以，徐徐進兵隘口，惟事招致，懸立重賞，冀生番等自行擒獻。殊不知此等生番，可以威懾而不可徒以利誘，況各社生番豈能一一賞賚。其未經賞者，又安能望其出力為官兵擒拏逆首耶。計小半天地方，相距林爽文竄逆之埔並社，埔尾，至遲不過三日路程，官兵即可到彼。若已將逆首擒獲，自必具摺馳奏。計本月十七、八日即當奏到。今已閱七日，尚未據奏到擒渠之信，又屬無望。畏事之人，稱內山係生番地界，不種五榖，該處生番俱係打生覓食；林爽文帶領夥匪數千，即在彼潛匿，無從得食。但自林爽文竄入內山以後，於福康安前此發摺時，已閱二十餘日，逆首等並未因人眾乏食，盡皆饑斃。又豈可徒在隘口堵截，林爽文一日不獲，即官兵一日不撤？經年累月與賊相持，雖駐兵日久經費亦屬小事，但台灣地方一交三月氣候即已炎熱，所調官兵內，如屯練貴州及別省兵丁素不耐濕熟。若至彼時尚在該處駐劄，必致易生疾病，其氣更餒。或林爽文聞知官兵不習水土，多有疾病，竟乘間潛出滋擾，或攔截官兵運送糧餉火藥之路，或將官兵前往府城通路中間攔截，關係甚重，皆不可不慮。況南路莊大田現在糾眾肆擾，常青祗辦自守，不能望其帶兵剿捕。設林爽文又在北路逞其狡猾伎倆，牽製大軍，更復成何事體耶。朕意，福康安此時與其在彼駐守，未能直入內山將逆首即時擒獲，豈可老師糜餉，不為改弦易轍之計？約計此旨到日，已屬二月中旬，如福康安已早將逆首擒獲，帶兵前往南路搜捕莊大田，固屬甚善；倘福康安接此旨時，尚未生擒逆首，不可不急思變計。竟當趁氣候尚未炎熱之時，將各隘口官兵撤回，逕趨南路將賊目莊大田拏獲，收復鳳山，肅清道路。其北路一帶，轉不妨示賊以隙，使林爽文聞知大兵業已撤去，或自內山逸出，希冀竄往他處，自尋生路；則逆首竄入內地，轉可易於搜剿。彼時福康安於廓清南路後，復移兵北向，四面截拏，攔其入山之路，自無難將逆首一鼓成擒。即使大兵撤後，難保林爽文不逃入內地，復行煽惑？但此亦不足為慮。前此，林爽文在北路及嘉義滋擾，各處村莊民人原俱被其煽誘迫脅，而大兵一到，無不立時殲除解散，紛紛奔潰。況林爽文當逃竄之餘，豈能復行糾結？即使潛相勾引，該處民人已知官兵聲勢，豈肯一一聽從；縱有聽糾入夥者，亦斷不能如前此之多。官兵再行搜剿，自必如摧枯拉朽，易於撲滅；反可淨盡根株，此事理之顯然者。福康安如尚未拏獲逆首，竟當遵旨而行，不必心存疑慮。倘更有何善計較此為勝者，亦不妨速行。總期大功剋日告蕆，原不必拘執也。
